在《超级机器人大战Z 再世篇》中，存在多个分歧点，这些分歧点会影响剧情的发展和最终的游戏结果。以下是主要的分歧点及其影响：
初始路线分歧
超级系路线（S）：
见送る
日本路线（A）：
地球で
宇宙路线（B）：
宇宙で
真实系路线（R）：
一绪に行く
隐藏机体获取
超时空要塞相关：
隐藏机体为YF29，需要通过分歧路线来获取。
多瑙α1：
在地球歼灭队路线中，铁人28与多瑙α1对话并选择说得，之后在31话选择地上路线可以加入。
角色生存与加入
艾纽：
在真实路线55话或IF路线57话前击坠数达到70，并且1周目击坠数要比奥兹玛、米歇尔、鲁卡、库兰、卡娜利亚多，可以选择宇宙路线，34话洛克昂击坠至少1机且总击坠40以上，刹那击坠撒切斯，洛克昂击坠艾纽，过关后艾纽生存并加入托勒密精神成员。
其他重要分歧
IF剧情：
在IF剧情中，50话罗洛存活加入，54话霍兰德加入。
其他隐藏要素：
兴奋剂安瓿：在18话中，吉诺移动到地图左下角，学院的左下绿草皮，坐标（2,29），可以获得出击气力+5。
卡米纳的眼镜：在20话后分歧路线选择黑暗大陆，23话西蒙第一次登场时，移动到卡米纳的雕像上可以获得，坐标（13,21），增加出击气力20。
这些分歧点不仅影响游戏的剧情走向，还会影响隐藏机体的获取以及某些角色的加入。建议玩家在游玩过程中仔细选择路线，以解锁所有隐藏内容和最佳的游戏体验。
